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奈良先端科学技術大学院大学 バイオサイエンス研究科

研究教育分野


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植物機能解析学研究室 (植物グローバル教育プロジェクト)

教授 田坂 昌生
特任准教授 稲田 のりこ、倉田 哲也、深尾 陽一朗
特任助教 藤原 正幸
E-mail { m-tasaka, norikoi, tekurata, fukao, fujimasa }@bs.naist.jp
研究室HP http://bsw3.naist.jp/plantglobal/
  • 田坂 昌生 教授

研究・教育の概要

本研究室は、植物科学グローバルトップ教育推進プログラム推進のために本バイオサイエンス研究科に設立されました。この文科省支援のプログラムでは、NAISTを中心に、東京大学・京都大学・名古屋大学との連携体制のもと、研究室・大学の枠を超えた教育体系を作り上げ、博士後期課程学生中心に、最先端技術の教育を進めます。最先端技術として、「ゲノム・トランスクリプトーム解析」「タンパク質複合体精製解析」「質量分析解析」「バイオイメージング解析」の4つの分野に着目し、それぞれ専任の教員により、最先端技術の開発と教育体系の確立を行います。また、本プログラムを通じて、全国の大学院生・若手研究者間のネットワーク作りを促進することにより、広い視野を持ち、世界をリードできる自立した研究者の育成を行います。

主な研究テーマ

1) ゲノム・トランスクリプトーム解析(倉田 哲也)
  • 統合オミクス解析による協調的な成長制御機構の研究
  • 高速シーケンサーを用いた微量サンプルからのゲノム、エピゲノム、トランスクリプトーム解析技術の開発
2) タンパク質複合体精製解析(藤原 正幸)
  • 植物免疫応答を制御するタンパク質複合体の研究
  • タンパク質複合体、相互作用因子解析法の開発
3) プロテオミクス(深尾 陽一朗)
  • プロテオミクス技術を用いたミネラルストレスに関する研究
  • 質量分析計を用いリン酸化量の絶対定量解析法の開発
4) バイオイメージング解析(稲田 のりこ)
  • 蛍光寿命イメージング顕微鏡による細胞内局所的温度変化の可視化
  • うどんこ病菌感染における植物免疫応答機構に関するイメージング解析
  • 図1 協調的な伸長成長と高速シーケンスデータ(図1) 協調的な伸長成長と高速シーケンスデータ
  • 図2 LTQ-Orbitrap XLとTSQ-Vantage(図2) LTQ-Orbitrap XLとTSQ-Vantage
  • 図3 うどんこ病菌感染時の植物応答イメージング(図3) うどんこ病菌感染時の植物応答イメージング

主な発表論文・著作

  1. Banks, J.A. et al., Science, 332, 960-963, 2011
  2. Uchida N. et a., Plant Cell Physiol., 52, 716-722, 2011
  3. 藤原正幸, 島本 功, 化学と生物, 47, 378-380, 2009
  4. Chen L. et al., Cell Host Microbe., 7, 185-96, 2010
  5. Fukao Y. et al., Plant Physiol., 155, 1893-1907, 2011
  6. Tamura K. et al., Plant Cell, 22, 4084-4097, 2010
  7. Inada, N, and Savory, E.A., J Gen Plant Pathol, in press, 2011
  8. Chandran, D., Inada, N., et al., PNAS, 107,460-465, 2010
  9. Iwai, M., Yokono, M., Inada, N., and Minagawa, J. PNAS, 107, 2337-2342, 2010

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