The Naistrap database

To look up the gene(s) of your interest, open a window by using "Ctrl + F"(Windows) or "Command (Apple mark) + F" (Macintosh) and give key words representing the gene(s).

(*) Ambiguity remains about the 5' border of the deleted region.
(**) "Unknown genes" stand for the DNA segments whose nucleotide sequences were either (1) found only in the genomic DNA contigs without any functional annotations or (2) not found anywhere in the current NCBI genome databases.
(***) The reverse (i.e., antisense) strand of a known gene was trapped.
(****) The trapped segment contained repetitive DNA sequences.
NT: not tested

1 2 3 4

 < Previous Page >   < Next Page >   < Home > 


 Clone number   Trapped gene   Expression  
 in ES cell 
 Identity   CDS in 
 mRNA 
 Deleted region   Trapped seq 
 13v-003   Unknown gene   |            click here ! 
 13v-004   Unknown gene               click here ! 
 13v-006   Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830076K11 product.      424/463 (92%)         click here ! 
 13v-007   Unknown gene               click here ! 
 13v-014   Mus musculus clone RP23-225M6 45S pre-ribosomal RNA gene, partial sequence; and intergenic spacer, partial sequence.      319/345 (92%)         click here ! 
 13v-016   Unknown gene               click here ! 
 13v-021   Unknown gene               click here ! 
 13v-022   Unknown gene               click here ! 
 13v-023   Unknown gene               click here ! 
 13v-024   Mus musculus farnesyltransferase,      248/250 (99%)   42..1355   1264..   click here ! 
 13v-025   Mus musculus, Similar to ubiquinol-cytochrome c reductase complex (7.2 kD), clone MGC:37480 IMAGE:4984172, mRNA, complete cds      241/243 (99%)   23..217   173..   click here ! 
 13v-029   Mus musculus RIKEN cDNA 0910001B06 gene (0910001B06Rik), mRNA      204/206 (99%)   17..328   186..   click here ! 
 13v-032   Unknown gene               click here ! 
 13v-041   Mus musculus 18-day embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1110039F03 product:unknown EST, full insert sequence   |   254/305 (83%)         click here ! 
 13v-043   Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700086P04 product:unknown EST, full insert sequence   |   483/485 (99%)         click here ! 
 13v-048   Unknown gene   |            click here ! 
 13v-064   Mus musculus hypothetical gene supported by AK086744 (LOC328000),mRNA   |   289/303 (95%)         click here ! 
 13v-067   vv62g08.x1 Soares_thymus_2NbMT Mus musculus cDNA clone,IMAGE:1227038 3' similar to gb:M60909 Mouse retinoicacid receptor alpha' mRNA, complete cds.   |   167/162 (97%)         click here ! 
 13v-069   Unknown gene   |            click here ! 
 13v-075   Mus musculus, nuclear transport factor 2, clone MGC:7387IMAGE:3487899, mRNA, complete cds   {{   356/356 (100%)   99..482   369..   click here ! 
 13v-076   Mus musculus glutathione peroxidase 1 (Gpx1), mRNA..   |   503/414 (98%)   38..643   284..   click here ! 
 13v-077   Mus musculus expressed sequence AI267078 (AI267078), mRNA   |   166/176 (94%)   1203..1499   1480..   click here ! 
 13v-078   Unknown gene   |            click here ! 
 13v-079   Unknown gene               click here ! 
 13v-081   Mus musculus tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein, zeta polypeptide (Ywhaz), mRNA.   {{   522/567 (92%)   54..791   54..791   click here ! 
 13v-085   Unknown gene               click here ! 
 13v-091   Mus musculus hypothetical gene supported by AK086535 (LOC330672),mRNA      166/173 (96%)         click here ! 
 13v-100   Unknown gene   |            click here ! 
 13v-104   Unknown gene               click here ! 
 13v-105   Mus musculus, clone IMAGE:1281305, mRNA   |   355/359 (99%)         click here ! 
 13v-107   Mus musculus mRNA for BTEB-1 transcription factor.   |   442/460 (96%)   1..735   516..   click here ! 
 13v-110   Unknown gene               click here ! 
 13v-111   vm96h05.r1 Knowles Solter mouse blastocyst B1 Mus musculus cDNA clone IMAGE:1006137 5', mRNA sequence.   |   255/272 (94%)         click here ! 
 13v-120   Unknown gene      |         click here ! 
 13v-122   Unknown gene               click here ! 
 13v-128   Mus musculus, RIKEN cDNA 2810417J12 gene, clone MGC:19377 IMAGE:2648415, mRNA, complete cds      175/181 (97%)   141..560   464..   click here ! 
 13v-132   Mus musculus DXImx39e protein (DXImx39e) mRNA, complete cds   {{   459/471 (97%)   1..537   451..   click here ! 
 13v-133   Unknown gene               click here ! 
 13v-134   Unknown gene   |            click here ! 
 13v-136   Unknown gene   |            click here ! 
 13v-140   Mus musculus similar to hypothetical protein MGC13024 [Homo sapiens] (LOC269999), mRNA.   {   707/731 (97%)   173..1045   412..   click here ! 
 13v-141   Mus musculus, RIKEN cDNA 2810026P18 gene, clone MGC:41526 IMAGE:1224948, mRNA, complete cds   {   139/169 (82%)         click here ! 
 13v-145   Unknown gene   |            click here ! 
 13v-155   Mus musculus transcriptional adaptor 3 (NGG1 homolog, yeast)-like (Tada3l), mRNA   {   439/462 (95%)   224..1522   1384..   click here ! 
 13v-157   Unknown gene               click here ! 
 13v-159   Mus musculus, platelet/endothelial cell adhesion molecule, clone MGC:6104 IMAGE:3592726, mRNA, complete cds      399/408 (98%)         click here ! 
 13v-163   Mus musculus DNA segment, Chr 3, MJeffers 1 (D3Jfr1), mRNA   {{   204/205 (100%)   393..2789   2742..   click here ! 
 13v-166   Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230070C17 product:unclassifiable, full insert sequence      327/381 (86%)         click here ! 
 13v-170   Unknown gene               click here ! 
 15v-004   M.musculus mRNA encoding CTP:phosphocholine cytidylyltransferase      522/529 (98%)   81..1184   298..   click here ! 
 15v-007   Mus musculus TTAGGG repeat binding factor 2 (mTRF2) mRNA, complete cds      229/258 (88%)   66..1553   620..   click here ! 
 15v-009   Mus musculus RIKEN cDNA C730048E16 gene, mRNA (cDNA clone MGC:25673 IMAGE:4503319), complete cds      559/635 (88%)   63..962   453..   click here ! 
 15v-012   Mus musculus solute carrier family 12, member 4 (Slc12a4), mRNA      197/219 (89%)   1..3258   313..   click here ! 
 15v-014   Mus musculus Arkadia (Arkadia) mRNA, complete cds      220/238 (92%)   346..3315   349..   click here ! 
 15v-018   BY749080 RIKEN full-length enriched, NOD-derived CD11c +vedendritic cells Mus musculus cDNA clone F630223M24 5'.      206/252 (81%)         click here ! 
 15v-019   Mus musculus cGMP phosphodiesterase (Pde9A2) mRNA, complete cds      137/152 (90%)   19..1623   303..   click here ! 
 15v-022   Mus musculus huntingtin interacting protein 2 (Hip2), mRNA      422/478 (88%)   215..817   452..   click here ! 
 15v-025   Mus musculus microtubule-actin crosslinking factor 1 (Macf1), mRNA      381/446 (85%)   172..16158   544..   click here ! 
 15v-026   Rattus norvegicus cyclin C (Ccnc), mRNA      281/335 (83%)   112..960   711..   click here ! 
 15v-031    Mus musculus nuclear receptor subfamily 0, group B, member 2 (Nr0b2),mRNA      616/679 (90%)   36..818   390..   click here ! 
 15v-033   Mus musculus formin binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:6618 IMAGE:3490113), complete cds      324/374 (86%)   138..1154   749..   click here ! 
 15v-034   unknown               click here ! 
 15v-040   unknown               click here ! 
 15v-046   Mus musculus RIKEN cDNA A630028F14 gene (A630028F14Rik), mRNA      574/662 (86%)   6..1049   243..   click here ! 
 15v-047   unknown               click here ! 
 15v-049   Mus musculus testis-specific NBR1 isoform (Nbr1) mRNA, complete cds      242/287 (84%)   624..3590   1535..   click here ! 
 15v-051   unknown               click here ! 
 15v-053   M.musculus TSC-22 mRNA      339/406 (83%)   187..618   530..   click here ! 
 15v-054   Mus musculus ubiquitin-conjugating enzyme E2D 2 (Ube2d2), mRNA      406/472 (86%)   387..830   409..   click here ! 
 16v-008   Mus musculus heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C (Hnrpc), mRNA   |   185/202 (91%)    157..1098   602..   click here ! 
 16v-012   Mus musculus enolase 3, beta muscle (Eno3), mRNA   |   327/388 (84%)   79..1383   1074..   click here ! 
 16v-021   Mus musculus RIKEN cDNA 1100001D10 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:6485405), partial cds   |   164/196 (83%)   <1..2035   1634..   click here ! 
 16v-023   Mus musculus solute carrier family 3 (activators of dibasic andneutral amino acid transport), member 2 (Slc3a2), mRNA   |   133/142 (93%)   129..1709   119..   click here ! 
 16v-027   Mus musculus ribosomal protein L5 (Rpl5), mRNA   |   477/525 (90%)   55..948   159..   click here ! 
 16v-028   vb75g04.y1 Soares mouse 3NME12 5 Mus musculus cDNA cloneIMAGE:762870 5'.   |   239/258 (92%)         click here ! 
 16v-029   Mus musculus adult male thymus cDNA, RIKEN full-length enrichedlibrary, clone:5830490F08 product:proteasome (prosome,macropain) 26S subunit, non-ATPase, 7, full insert sequence   |   603/654 (92%)   82..>1017   340..   click here ! 
 16v-031   Mus musculus RIKEN cDNA 1700001N19 gene, mRNA (cDNA clone MGC:54873IMAGE:6312211), complete cds   |   124/143 (86%)   23..1429   400..   click here ! 
 16v-034   unknown   |            click here ! 
 16v-037   Mus musculus 10 days neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4732497M05 product:nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, full insert sequence   |   254/313 (81%)   35..2137   155..   click here ! 
 16v-038   Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430109D21 product:hypothetical SNF2 related domain containing protein, full insert sequence   |   580/633 (91%)   297..>2534   308..   click here ! 
 16v-039   Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230053O12 product:weaklysimilar to PROTEIN TRANSPORT PROTEIN SEC24A(SEC24-RELATED PROTEIN A) (FRAGMENT) [Homo sapiens],full insert sequence   |   383/481 (79%)         click here ! 
 16v-040   Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430109D21 product:hypothetical SNF2 related domain containing protein, full insert sequence   |   580/633 (91%)   297..>2534   308..   click here ! 
 16v-045    Mus musculus enolase 3, beta muscle (Eno3), mRNA   |   140/148 (94%)   79..1383   134..   click here ! 
 16v-046   Mus musculus cell death-inducing DNA fragmentation factor, alpha subunit-like effector A (Cidea), mRNA   |   525/573 (91%   214..867   543..   click here ! 
 16v-047   Mus musculus golgi phosphoprotein 2 (Golph2), mRNA   |   521/622 (83%)   41..1222   352..   click here ! 
 16v-050   Mus musculus LOC269911 (LOC269911), mRNA   |   89/96 (92%)   18..632   535..   click here ! 
 16v-051   Mus musculus sema domain, immunoglobulin domain (Ig), transmembranedomain (TM) and short cytoplasmic domain, (semaphorin) 4B (Sema4b), mRNA   |   376/425 (88%)   281..2752   680..   click here ! 
 16v-056   Mus musculus kringle containing transmembrane protein (Kremen),mRNA   |   94/98 (95%)   49..1470   297..   click here ! 
 16v-057   Mus musculus nogo-66 receptor homolog 2, mRNA (cDNA clone MGC:40829IMAGE:5368560), complete cds   |   553/615 (89%)   494..1831   505..   click here ! 


1 2 3 4

 < Previous Page >   < Next Page >   < Home >